La sala de Botánica cuenta con una exposición de plantas, hongos y líquenes, útiles para desarrollar actividades con fines didácticos y divulgativos.
Los plantas con semillas (espermatófitos) están ordenadas por orden de importancia económica para el hombre: cereales, legumbres, hortalizas, frutas y frutos, plantas aromáticas y especias, plantas tinctoreas y fibras. En gimnospermas se expone una representación de piñas (flores femeninas de las coníferas).
Los modelos en resina de diferentes tipos de plantas son muy útiles para que los visitantes vean las distintas partes de los órganos reproductores de las plantas con flor.
Los hongos están representados por una exposición de maquetas de los principales grupos.
